Neutrinoless ββ\beta\beta-decay nuclear matrix elements from two-neutrino ββ\beta\beta-decay data

We study two-neutrino ($2\nu\beta\beta$) and neutrinoless double-beta ($0\nu\beta\beta$) decays in the nuclear shell model and proton-neutron quasiparticle random-phase approximation (pnQRPA) frameworks. Calculating the decay of several dozens of nuclei ranging from calcium to xenon with the shell model, and of $\beta\beta$ emitters with a wide range of proton-neutron pairing strengths in the pnQRPA, we observe good linear correlations between $2\nu\beta\beta$- and $0\nu\beta\beta$-decay nuclear matrix elements for both methods. We then combine the correlations with measured $2\nu\beta\beta$-decay half-lives to predict $0\nu\beta\beta$-decay matrix elements with theoretical uncertainties based on our systematic calculations. Our results include two-body currents and the short-range $0\nu\beta\beta$-decay operator.Comment: 10 pages, 8 figures, 3 tables; supplemental material include

Propuesta didáctica para descubrir la ruta de los molinos en Banyeres de Mariola, a través del aprendizaje experiencial

El Trabajo de Fin de Grado (TFG) que se expone a continuación, trata de mostrar la importancia y el valor educativo que tienen las salidas al entorno o medio natural, en Educación Primaria. De esta forma, se intenta promover la enseñanza de las Ciencias Naturales en el ámbito educativo, a través de una educación interdisciplinar, basada en el aprendizaje experiencial. Así, se cambiará la enseñanza en el aula, por el descubrimiento de contenidos a través de las vivencias y el contacto directo con el medio que nos rodea. Para ello, contando con aquellos elementos que nos ofrece el entorno, se ha elaborado una propuesta educativa, que pueda servir a los docentes, para llevarla a cabo. Dicha propuesta, propone un recorrido en el medio natural de “la ruta de los molinos”, elaborando así los recursos necesarios para su preparación, desarrollo y evaluación. En el proyecto se detalla la información necesaria acerca de lo más destacado sobre la ruta, así como recomendaciones, aspectos a tener en cuenta y posibles ampliaciones didácticas sobre la misma. Finalmente se podrán ver las reflexiones y conclusiones, analizando si se cumplen los objetivos iniciales, a través de ofrecer un aprendizaje lúdico, que fomenta valores cooperativos, capta la atención del alumnado, favorece la motivación y permite disfrutar construyendo su propio conocimiento a los alumnos, mediante del aprendizaje experiencial.Grado en Educación Primari

Biodegradación de plásticos en ambientes naturales

57 p.Los plásticos son materiales poliméricos de alto peso molecular presentes en nuestro día a día debido a sus múltiples usos. La contaminación por plásticos se ha visto incrementada en los últimos años ocasionando graves impactos en entornos naturales terrestres y acuáticos. Ante este escenario, el aprovechamiento de la capacidad de ciertos microorganismos para degradar plásticos supone una oportunidad para reducir esta problemática. Solo considerando los denominados bioplásticos, se han identificado más de 90 tipos de microorganismos degradadores, principalmente bacterias y hongos. La biodegradación de plásticos en entornos naturales está afectada por múltiples factores como las condiciones ambientales, las características del polímero y las características de las enzimas microbianas degradativas. En relación con estas, destacan las hidrolasas, lipasas y cutinasas, por su capacidad de atacar distintos tipos de plásticos. La información existente ha evidenciado la biodegradación de determinados plásticos en sistemas acuáticos (oceánicos y fluviales) y en sistemas terrestres (compost y suelos) tanto en condiciones naturales como de laboratorio. Sin embargo, la degradación microbiana de materiales plásticos es un proceso lento y que presenta diversas limitaciones derivadas de las características intrínsecas de los plásticos como su baja biodisponibilidad y elevado peso molecular. Por ello, se han propuesto diversas estrategias para su optimización, como la modificación genética de los microorganismos o la mejora de la termoestabilidad enzimática requerida para aumentar la eficiencia del proceso. Además, datos recientes sugieren la aplicabilidad de la actividad microbiana para producir compuestos de alto valor añadido a partir de productos derivados de los procesos de despolimerización de los plásticos.Plastics are a wide number of polymeric materials with high molecular weight that are present in our day by day because of their multiple applications. In the last decades, plastic pollution has rapidily increased, leading to harmful impacts in natural aquatic and terrestial environments. In this scenario, the use of the ability of some microorganisms to degrade plastics becomes an opportunity to minimize this issue. More than 90 types of microorganisms able to degrade bioplastics have been identiffied, mainly bacteria and fungi. Plastic biodegradation in natural environments is affected by multiple factors such as the environmental conditions, the physic chemical characteristics of the polymer, and features of the microbial degradative enzymes. A wide number of enzymes has been reported to be involved in the biodegradation, such as hydrolases, lipases and cutinases, able to degrade several types of plastics. Plastic biodegradation has been found in aquatic environments (oceans and rivers) and terrestrial environments (compost and soils). However, plastic biodegradation rate is low, and this process still presents several limitations, mainly related with intrinsic properties of plastics such as low bioavailability and high molecular weight. Recently, there has been biotechnological advances for the optimization of the biodegradation process, mainly related to genetic engineering and modification of biodegradative enzymes to improve their thermostability. Additionally, new approaches are being explored to exploit the microbial activity to produce high value compounds from plastic wastes.Grado en Ciencias Ambientale

Soluciones bioinformáticas para el análisis de datos ómicos, descubrimiento de conocimiento y diagnóstico genético en Sparus aurata y otros organismos biológicos

Esta tesis ha sido financiada por el Ministerio de Ciencia e Innovación a través de la ayuda “DI-17-09134” para contratos para la formación de doctores en empresas (Doctorados Industriales).Con el incremento de datos generados mediante el uso de las tecnologías de secuenciación, es necesario el diseño de protocolos y herramientas que permitan el análisis y la integración de los mismos con el objetivo de entender y comprender los sistemas biológicos que forman parte de cada estudio en particular. Estas herramientas, además, es preferible que sean intuitivas y de fácil manejo para los usuarios, de manera que puedan ser utilizadas por cualquier investigador y no solamente por aquellos que sean expertos o tengan un conocimiento más avanzado en el campo de la bioinformática. En esta tesis se presentan una serie de herramientas destinadas al análisis de datos procedentes de secuenciación para dar soporte a los estudios llevados a cabo en colaboración con distintas instituciones como son el Instituto de Acuicultura Torre de la Sal (IATS-CSIC), el Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Salamanca (IRNASA), la Fundación Jiménez Díaz, el Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC y el Hospital General Universitario de Valencia. En primer lugar, se desarrolló e implementó un flujo de trabajo para el ensamblaje de novo y anotación de genomas eucariotas ricos en duplicaciones, el cual se incluyó en la herramienta DeNovoSeq. Este protocolo fue testado ensamblando de novo y anotando el genoma de Sparus aurata (dorada) a partir de datos de secuenciación aportados por el IATS-CSIC. Como resultado, este protocolo no solo permitió la obtención de un borrador de alta calidad del genoma de la dorada y con un tamaño (1,24 Gb) más próximo al esperado según el análisis de k-mer realizado, sino que permitió establecer una hipótesis sobre el origen de la mayor parte de las expansiones sufridas por el genoma de esta especie, sugiriendo que estas derivan de las actividades de los elementos genéticos móviles y de la respuesta inmunitaria como procesos para la adaptabilidad de la especie. En segundo lugar, se rediseñó y adaptó un pipeline, llamado VQS-haplotyper, a partir de un pipeline creado por Mercedes Guerrero-Murillo y Josep Gregori i Font, y basado en el paquete de R llamada QSutils, para la identificación y cuantificación de cuasiespecies en muestras procedentes de pacientes infectados por un virus concreto. En este caso, se utilizaron muestras de pacientes infectados por el virus SARS-CoV-2 proporcionadas por la Fundación Jiménez Díaz. La modificación del pipeline original nos permitió obtener los cambios de nucleótidos y deleciones que caracterizaban los haplotipos presentes en las muestras para una abundancia relativa mínima de 0,5% y 0,1%, obteniendo un total de 105 y 1.154 mutaciones y/o deleciones, respectivamente. De esta manera, VQS-haplotyper es capaz de detectar pequeños cambios en la secuencia de un virus que pueden influir en las características del mismo. En tercer lugar, se desarrollaron e implementaron dos protocolos para el análisis de datos RNA-seq, incluyendo el análisis de enriquecimiento de términos GO y rutas metabólicas, uno a partir de datos procedentes de secuenciación de novo, es decir, sin genoma de referencia disponible, y otro a partir de datos procedentes de resecuenciación, es decir, con genoma de referencia disponible. Estos dos protocolos se implementaron para dar soporte a diversos estudios utilizando muestras de las siguientes especies: Ornithodoros erraticus y Ornithorodos moubata, proporcionadas por el IRNASA; Anisakis pegreffii, Anisakis simplex s.s. y sus híbridos, proporcionadas por el Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC; Homo sapiens, proporcionadas por el Hospital General Universitario de Valencia. Complementariamente al protocolo para el análisis RNA-seq sin genoma de referencia disponible, ha sido necesario desarrollar un protocolo para el ensamblaje de novo de transcriptomas consenso contra el que, posteriormente, se mapeen las lecturas. Ambas implementaciones han permitido conocer las diferencias entre distintas condiciones de estudio o entre distintas especies. Con ello, es posible establecer potenciales antígenos que puedan ser diana para posibles terapias o vacunas, dilucidar posibles relaciones y diferencias entre distintas especies o descubrir biomarcadores de, por ejemplo, cáncer. Por último, en colaboración con el IATS-CSIC, desarrollamos SAMBA (Structure-Learning of Aquaculture Microbiomes Using a Bayesian-Network Approach), una implementación informática de un modelo de red bayesiano para investigar cómo se relacionan entre sí los pan-microbiomas de los peces y todas las demás variables de un sistema acuícola concreto. SAMBA se basa en un modelo entrenable de red bayesiana que aprende la estructura de red de un sistema de acuicultura utilizando información de distintas variables bióticas y abióticas de importancia en la piscicultura, con especial atención a los datos microbianos proporcionados por la secuenciación de amplicones 16S. SAMBA acepta variables tanto cualitativas como cuantitativas y trata de forma convincente las diferencias en la composición microbiana derivadas de la variación técnica o biológica entre microbiomas de distintos especímenes. Para ello, SAMBA contiene una variedad de herramientas para preanalizar los datos y elegir una distribución para construir y entrenar el modelo de red bayesiana. Una vez creado y validado el modelo, el usuario puede interrogarlo y obtener información sobre el sistema modelizado en dos modos diferentes: “Report” y “Prediction”. En el modo “Report”, SAMBA informa de cómo el pan-microbioma y todas las demás variables que intervienen en el sistema de acuicultura modelizado se influyen mutuamente y cuáles son las probabilidades de cada relación. En el modo “Prediction”, la aplicación predice cómo cambiarían probablemente la diversidad y el perfil funcional del pan-microbioma en función de cualquier cambio realizado en otras variables. Finalmente, SAMBA implementa un completo editor gráfico de redes que permite navegar, editar y exportar los resultados. El funcionamiento de SAMBA ha sido testado y validado utilizando estándares de comunidades microbianas y comunidades de microbiota intestinal de doradas de piscifactoría (Sparus aurata) procedentes de diferentes ensayos de alimentación, arrojando un valor de precisión en todos los casos superior al 0,62. En definitiva, esta tesis ha contribuido no solamente con el desarrollo de protocolos y herramientas que permiten y facilitan el análisis y la integración de diferentes datos NGS, sino que, además, ha contribuido con nuevo conocimiento biológico en diversos campos de estudio.With the increase in data generated through the use of sequencing technologies, there is a need to design protocols and tools that allow the analysis and integration of these data in order to understand and comprehend the biological systems that are part of each particular study. These tools, moreover, should preferably be intuitive and user-friendly, so that they can be employed by any researcher and not only by those that are experts or have a more advanced knowledge in the field of bioinformatics. This thesis presents a series of tools for the analysis of sequencing data so as to provide support for the studies carried out in collaboration with different institutions such as Instituto de Acuicultura Torre de la Sal (IATS-CSIC), Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Salamanca (IRNASA), Fundación Jiménez Díaz, Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC and Hospital General Universitario de Valencia. Firstly, a workflow for de novo assembly and annotation of duplication-rich eukaryotic genomes was developed and implemented, and was included in the DeNovoSeq tool. This protocol was tested by de novo assembly and annotation of the Sparus aurata (gilthead sea bream) genome from sequencing data provided by the IATS-CSIC. As a result, this protocol not only allowed us to obtain a high quality draft of the gilthead sea bream genome with a size (1.24 Gb) closer to the expected size according to the k-mer analysis performed, but also allowed us to establish a hypothesis about the origin of most of the expansions suffered by the genome of this species. This suggests that they derive from the activities of the mobile genetic elements and the immune response as processes for the adaptability of the species. Secondly, a pipeline, called VQS-haplotyper, was adapted and redesigned from a pipeline created by Mercedes Guerrero-Murillo and Josep Gregori i Font, and based on the R package called QSutils, to identify and quantify quasispecies in samples from patients infected by a specific virus. In this case, samples from patients infected by the SARS-CoV-2 virus provided by the Fundación Jiménez Díaz were used. The modification of the original pipeline allowed us to obtain nucleotide changes and deletions that characterized the haplotypes present in the samples for a minimum relative abundance of 0.5% and 0.1%, obtaining a total of 105 and 1,154 mutations and/or deletions, respectively. In this way, VQS-haplotyper is able to detect small changes in the sequence of a virus that can influence its characteristics. Thirdly, two protocols were developed and implemented to analyze RNA-seq data, including the enrichment analysis of GO terms and metabolic pathways, one from de novo sequencing data, i.e. with no reference genome available, and the other from resequencing data, i.e. with reference genome available. These two protocols were implemented to provide support for several studies using samples from the following species: Ornithodoros erraticus and Ornithodors moubata, provided by the IRNASA; Anisakis pegreffii, Anisakis simplex s.s. and their hybrids, provided by the Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC and Homo sapiens, provided by the Hospital General Universitario de Valencia. Complementary to the protocol for RNA-seq analysis with no reference genome available, it has been necessary to develop a protocol for the de novo assembly of consensus transcriptomes against which, subsequently, the reads are mapped. Both implementations have provided insight into the differences between distinct study conditions or between distinct species. With this, it is viable to establish potential antigens that could be targets for possible therapies or vaccines, to elucidate possible relationships and differences between different species or to discover biomarkers of, for example, cancer. Finally, in collaboration with the IATS-CSIC, we developed SAMBA (Structure-Learning of Aquaculture Microbiomes Using a Bayesian-Network Approach), a computer implementation of a Bayesian network model to investigate how fish pan-microbiomes and all other variables in a given aquaculture system are related to each other. SAMBA is powered by a Bayesian network trainable model that learns the network structure of an aquaculture system using information from distinct biotic and abiotic variables of importance in fish farming, with special focus on microbial data provided from 16S amplicon sequencing. SAMBA accepts both qualitative and quantitative variables and convincingly deals with the differences in microbial composition derived by the technical or biological variation among microbiomes of distinct specimens. To this end, SAMBA is implemented with a variety of tools to pre-analyze the data and choose a distribution to build and train the Bayesian network model. Once the model has been created and validated, the user can interrogate the model and obtain information about the modelled system in two different modes: Report and Prediction. Using the Report mode SAMBA reports how the pan-microbiome and all other variables involved in the modelled aquaculture system influence each other and what the conditional probabilities of each relation are. Under the Prediction mode, the application predicts how the diversity and functional profile of the pan-microbiome would likely change depending on any alteration made on other variables. Finally, SAMBA implements a comprehensive graphical network editor allowing the user to navigate, edit and export outcomes. The performance of SAMBA has been tested and validated using microbial community standards and gut microbiota communities of farmed gilthead sea bream (Sparus aurata) from different feeding trials, giving an accuracy value in all cases higher than 0.62. In conclusion, this thesis has not only contributed to the development of protocols and tools that allow us to facilitate the analysis and integration of different NGS data, but has also contributed with new biological knowledge in various fields of study

Estudio y análisis del acoso escolar en Educación Infantil: prevención desde el aula

En el presente trabajo se va a tratar de una manera crítica, a través del relato de casos reales, el acoso escolar, o también conocido por el término anglosajón “bullying”. El objetivo principal que se pretende conseguir es mostrar a la sociedad la importancia de este problema social, que cada día afecta a más niños y niñas en los centros educativos desde muy pequeños, dejando constancia de que aquello que a veces parecen “cosas de niños”, no siempre lo son. Es por eso que se van a abordar diferentes cuestiones acerca de qué es el acoso, los signos, los métodos para detectarlo y las medidas de prevención e intervención. La metodología llevada a cabo a lo largo de esta investigación es de carácter cualitativo, situada dentro del paradigma socio-crítico, donde se pretende conocer la realidad para más tarde, en el caso necesario, mejorarla o cambiarla. Para ello se realiza una investigación teórica acerca de esta temática, con el objetivo de identificar los antecedentes que se conocen, los signos de alarma, cómo afecta a las víctimas y a su entorno, cuál puede ser el perfil de un acosador y cómo intervenir adecuadamente desde el ámbito escolar y desde la ley. Para poder profundizar sobre el tema, se han llevado a cabo diversas actuaciones. En las aulas de Educación Infantil se han realizado sociogramas, los cuales nos van a permitir conocer la relación entre los diferentes componentes del grupo-clase, pudiendo detectar posibles casos presentes y futuros. Por otro lado, para llegar a saber el grado de conocimiento y concienciación que tiene la sociedad sobre esta problemática, se ha elaborado una encuesta online. Finalmente, para dar una visión más real, se han mantenido diversas entrevistas con profesores, padres, agentes de seguridad nacional y con las mismas víctimas. Con todo esto, se tendrá la oportunidad de poder detectar posibles problemas y plantear posibles métodos de prevención, como los cuentos infantiles, para poder intervenir adecuadamente.Grado en Educación Infanti

Valoración Clínica y Tamizaje de Laboratorio del Síndrome Metabólico en pacientes de la Maternidad de María 2020

La investigación pregrado denominada ?Valoración Clínica y Tamizaje de Laboratorio del Síndrome Metabólico en pacientes de la Maternidad de María 2020? se realizó con un diseño Básico, Descriptivo, No Experimental, Prospectivo, Cuantitativo, y planteo como objetivo Determinar las características de la valoración clínica y tamizaje de laboratorio, el síndrome metabólico en pacientes de la Maternidad de María 2020 y problema de investigación ¿Cuáles son las características de la valoración clínica y tamizaje de laboratorio del Síndrome Metabólico en pacientes de la Maternidad de María 2020? Población: conformada por los pacientes referidos para estudio de Síndrome Metabólico y la muestra incluyó a 80 pacientes, la metodología implico la revisión de reportes y libro de registro de resultados de laboratorio. Resultados: Se halló 45% son hombre y 55% mujeres; 3.8% de niños; 3.8% de adolescentes; 12.5% jóvenes; 41.3% adultos; y 38.8% adultos mayores; según valoración del IMC y nivel de riesgo se encontró que el 36.3% tenían IMC normal y nivel de riesgo promedio; 57.5% Sobrepeso y nivel de riesgo aumentado; 6.3% Obesidad grado I y nivel de riesgo moderado; según niveles de Hb 31% de anemia Grado I (leve); anemia Grado II 1.3% (moderada); anemia Grado IV 1.3% (Grave); y 66.3% sin anemia; de acuerdo niveles de glucosa tamizados se halló que el 72% valores normales (Tesi

Development and Innovation in Cooked Ham Produced in Spain

The production of cooked ham has been gaining popularity in recent years in Spain. In general, the production process carried out by the companies remains traditional, and different production methods are therefore being sought to innovate and improve the quality of the product. This is either through pig crossbreeding, varying additives and ingredients, improving some stages of the production process, or providing nutritional and health claims that are useful to guiding the purchasing decision of consumers. Obviously, this series of changes must be subject to Spanish and European regulations in order to be marketed inside and outside the countryDepto. de Química InorgánicaFac. de Ciencias QuímicasTRUEUCLMpu

Improved Determination of Q Quality Factor and Resonance Frequency in Sensors Based on the Magnetoelastic Resonance Through the Fitting to Analytical Expressions

The resonance quality factor Q is a key parameter that describes the performance of magnetoelastic sensors. Its value can be easily quantified from the width and the peak position of the resonance curve but, when the resonance signals are small, for instance when a lot of damping is present (low quality factor), this and other simple methods to determine this parameter are highly inaccurate. In these cases, numerical fittings of the resonance curves allow to accurately obtain the value of the quality factor. We present a study of the use of different expressions to numerically fit the resonance curves of a magnetoelastic sensor that is designed to monitor the precipitation reaction of calcium oxalate. The study compares the performance of both fittings and the equivalence of the parameters obtained in each of them. Through these numerical fittings, the evolution of the different parameters that define the resonance curve of these sensors is studied, and their accuracy in determining the quality factor is compared.B.S. thanks the Basque Government for funding under the FPI grant PRE_2019_1_0200. The authors would like to thank the financial support from the Basque Government under µ4indust project (KK-2019/00101, Elkartek program) and University Basque Research Groups Funding (IT1245-19)

Principal Criteria for Evaluating the Quality, Safety and E cacy of hMSC-Based Products in Clinical Practice: Current Approaches and Challenges

Human Mesenchymal Stem Cells (hMSCs) play an important role as new therapeutic alternatives in advanced therapies and regenerative medicine thanks to their regenerative and immunomodulatory properties, and ability to migrate to the exact area of injury. These properties have made hMSCs one of the more promising cellular active substances at present, particularly in terms of the development of new and innovative hMSC-based products. Currently, numerous clinical trials are being conducted to evaluate the therapeutic activity of hMSC-based products on specific targets. Given the rapidly growing number of hMSC clinical trials in recent years and the complexity of these products due to their cellular component characteristics and medicinal product status, there is a greater need to define more stringent, specific, and harmonized requirements to characterize the quality of the hMSCs and enhance the analysis of their safety and efficacy in final products to be administered to patients. These requirements should be implemented throughout the manufacturing process to guarantee the function and integrity of hMSCs and to ensure that the hMSC-based final product consistently meets its specifications across batches. This paper describes the principal phases involved in the design of the manufacturing process and updates the specific technical requirements needed to address the appropriate clinical use of hMSC-based products. The challenges and limitations to evaluating the safety, efficacy, and quality of hMSCs have been also reviewed and discussed.This work was supported by Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Plan Estatal I+D+I, Grant Number: RTI2018-095410-B-100; Spanish Ministry of Economy (MINECO), Grant Number: RD16/0011/0030; Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities (to JAG) and by the Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (FEDER funds, project RTC-2016-5451-1) (to BC and PG-M). Additional it has been developed in the context of AdvanceCat with the support of ACCIÓ (Catalonia Trade & Investment; Generalitat de Catalunya) under the Catalonian European Regional Development Fund operational program, 2014-2020 (to PG-M)